El NEES surge en el año 1993, por Resolución Nº 216/93 del Consejo Académico de la Facultad de Ciencias Humanas, como iniciativa de docentes-investigadores del Departamento de Ciencias de la Educación, incorporándose posteriormente profesores pertenecientes a otras carreras y disciplinas afines. Actualmente está integrado por un equipo de investigadores que, distribuidos en varios proyectos de investigación, abordan la problemática educativa desde múltiples perspectivas de análisis.

Desde su creación ha privilegiado multiplicidad de abordajes disciplinarios y miradas teórico metodológicas sobre el campo educativo. Los proyectos radicados en el Núcleo -todos acreditados por el Ministerio de Educación, el Ministerio de Ciencia y Tecnología, así como organismos nacionales y provinciales de ciencia y técnica- con sus respectivas líneas de investigación dan cuenta de esta característica, así como de la heterogeneidad y complejidad de la investigación en el campo educativo.